本書點校部分，以中研院歷史語言研究所傳斯年圖書館藏盧見曾補刻本為底本，加上新式標點；以文淵閣四庫全書本（簡稱『文淵閣四庫本』）、文津閣四庫全書本（簡稱『文津閣四庫本』）、四部備要本（簡稱『備要本』），詳加校勘。補正部分，則據廣文書局影印之翁方綱經義考補正（簡稱『補正』）、台灣商務印書館景印文淵閣四庫全書總目（簡稱『四庫總目』）、廣文書局影印之羅振玉經義考目錄校記（簡稱『校記』）。 若補正、四庫總目、校記有辨正經義考著錄書名、撰者、篇卷、存佚、敘錄之疏誤時，則將辨正、補充之文字列於該目之後，並加上『補正』、『四庫總目』、『樣鈁』字樣，以與經義考正文區別，其排列亦較經義考本文低一格。 若補正、四庫總目、校記對經義考著錄之某書皆有辨正文字時，則依以上諸書成書先後，依序排列。 補正、四庫總目、校記提正經義考者，僅摘錄其提正部分之文字，並詳錄其卷數、頁數於該段文字之下；然四庫總目著錄之書名與經義考所著錄者，有名異實同之現象，如經義考著錄魏了翁春秋要義，四庫總目作春秋左傳要義，故引總目文字之後，注明：『卷二十七，頁二十一——二十二，春秋左傳要義三十一卷提要。』另外，四庫總目辨正經義考所著錄之經書，如辨正陳傅良之左氏章指，卻在春秋後傳提要論及之，如此類者，則以春秋後傳提要注明之。 校記列經義考著錄亡佚之書若干後，則提『馬國翰均有輯本』或『黃爽均有輯本』。凡校記提示有輯本者，本書皆分別陳敘其文字於經義者著錄該書亡佚部分之後。 標點方式，以新式標點符號為准，書名、篇名用書名號，人名、地名、朝代、年號等用專名號。 經義考所錄諸家文字，若為全引，則以引號識之，如為約引，則僅加以標點，不加引號。 盧氏補刻本有不少俗字，除部分引文為保留原書字樣外，皆改為現行通行字，如『蓋』改為『蓋』、『備』改為『備』、『據』改作『據』『概』改作『概』等。 盧氏補刻本原有盧氏所編總目二卷，因僅列卷目，不列書名、作者，茲刪去。另重編有書名、作者之目次，列為首冊。 為方便讀者檢索，本書編有著錄書目之書名和作者索引，附於首冊目次之後。

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